Воины SD Gashapon мирно живут в своем доме, SD Nation, пока однажды в небе не появился таинственный НЛО и не захватил Мать SD и ее инженера Эми. SD Warriors обнаруживают, что они были захвачены злой армией под названием Dark Brain, стремящейся создать свою собственную злую империю SD. Теперь SD Warriors должны вместе отправиться на спасение Эми и восстановить мир на своей земле!

SD Hero Sōkessen - это скролл-платформер, в котором представлены миниатюрные версии известных героев японского телевидения из таких сериалов, как Ультрачеловек, Камен Райдер, SD Гандам и Учу Кейджи. Всего доступно двенадцать персонажей, по три из каждой серии, каждый со своими способностями. Единственный способ переключать персонажей - собирать бонусы, сброшенные врагами.

Чтобы спасти Эми, игрок должен пройти девять этапов, каждый с боссом в конце. По пути самые разные враги из каждой серии персонажей будут изо всех сил стараться остановить героев.