В StarTropics вы играете за Майкла Джонса. Дядя Майка (доктор Джонс, известный археолог) находится на острове C и ищет там некоторые потерянные руины. Он пригласил Майка посетить его. Однако вскоре после прибытия на остров, Майк узнает, что докторр Джонс недавно был похищен! Теперь Майку нужно найти доктора Джонса и выяснить, почему он был похищен.

StarTropics - это игра представляет собой смешение нескольких жанров, есть тут даже элементы логики. Майку нужно будет бродить по острову в поисках доктора Джонса. Жители деревни могут предложить некоторые подсказки, также там много опасных врагов, которых нужно одолеть. На пути вам встретится множество новых видов оружия и других предметов, которые помогут Майку в его поисках. В картридже использовалась резервная батарея, позволяющая сохранять игры.